A gestão e a operação do sistema municipal de resíduos de Santa Cruz são asseguradas pela Subunidade de Resíduos Sólidos Urbanos, integrada na Divisão de Ambiente. Esta estrutura é responsável pela remoção e pelo transporte dos resíduos, bem como pela coordenação dos meios necessários ao funcionamento do serviço.
Para assegurar estas operações, o Município dispõe de cerca de 100 trabalhadores, apoiados pelo Ecocentro Municipal e por uma frota própria de recolha e transporte.
A frota operacional do Município é composta por cerca de 30 viaturas, 80% das quais veículos pesados. Em conjunto, estas viaturas percorrem aproximadamente 300 mil quilómetros por ano.